Алек Попов е роден в София през 1966 г. Завършил е Националната гимназия за древни езици и култури “Константин Кирил Философ” и българска филология в софийския университет „Св. Климент Охридски”.
Автор на романите „Мисия Лондон”, „Черната кутия”, „Сестри Палавееви в бурята на историята”, „Сестри Палавееви по пътя към новия свят”, на есеистичната книга „Спътник на радикалния мислител”, както и на редица сборници с разкази, сред които „Другата смърт”, „Мръсни сънища”, „Ниво за напреднали”,„Митология на Прехода”, „Телесни плевели”. Алек Попов е сред най-превежданите и четени съвременни български писатели. Романът му „Мисия Лондон” е издаден на 16 езика. Романът „Черната кутия” има няколко издания на немски, преведен е също на английски, турски, сръбски, полски, италиански. Разказите и есетата му са включени в редица международни антологии, сред които „Best European Fiction 2011”.
По разказите на Алек Попов са създадени няколко филма. Той активно участва в театралните и филмови адаптации на своите произведения. Съсценарист е на филма „Мисия Лондон” по едноименния му роман, който се задържа на екран 30 седмици и е гледан от близо 400 000 зрители. Автор е на шест радиопиеси, излъчвани по БНР, на театрални пиеси, поставяни на различни сцени. Консултант е на няколко филмови и телевизионни проекта.
Сред литературните отличия, които писателят е получил през годините са: наградата за фантастика „Гравитон”; наградата за нова българска проза „Хеликон” ( 2002, 2013); наградата за драматургия “Иван Радоев”, наградата „Елиас Канети”, „Цветето на Хеликон” за най-продавана книга на 2007 и 2013 г., призът „Четящият човек”, наградата за преводна литература на британския ПЕН Център, наградата за хумористичен разказ „Чудомир”. През 2012 г. Алек Попов е избран за член-кореспондент на Българската академия на науките в отдела творци на изкуството.